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Détection de répétitions
FORRepeats : une méthode linéaire en temps et en espace pour détecter des répétitions sur des génomes complets et pour comparer des génomes.
Avantages :
* Très rapide et économique en espace (1 seconde et 10Mo pour une séquence de 1Mb) ;
* Très facile à implémenter.
Disponibilité :
FORRepeats n'est pas encore disponible. Si vous êtes intéressé, contactez moi : une liste de diffusion est en cours d'élaboration.
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Compression de données
Compror 2.1 : un compresseur de données expérimental, développé sous et pour linux.
Xorc 1.0 : version graphique de Compror.
Développé en Tk/Perl, facile à installer (suivre les instructions du fichier README),
il vous permet d'utiliser compror,
renommé pour l'occasion en orc (oracle compression).
Il crée des fichiers .orc et décompresse vos fichiers .orc.
Afin de comptabiliser le nombre d'utilisateurs potentiels de notre compresseur et de corriger
d'éventuels bugs, merci de m'écrire lorsque vous téléchargez cette version de compror,
et lorsque vous avez des remarques.
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Utilitaires
psexplode : script Perl pour
découper un fichier postscript.
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Posters, algorithmes et emplois du temps avec LaTeX
Créez vos posters A0 avec la classe
ABISS_poster, écrivez vos algorithmes avec le style ALgo ou créez vos emploi du temps avec la classe edt pour LaTeX.
Téléchargez-les ici.
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